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ジョブ投入

計算機はジョブスケジューラによって管理されています.
基本的なジョブの確認,投入方法は大型計算機利用マニュアルをご参照ください.

ジョブスクリプトの作成

コンパイル済みの実行ファイルをバッチジョブとして実行するには,ジョブスケジューラに渡すジョブスクリプトが必要です.

ジョブスクリプト

以下のページをご参照ください.


ログイン後,以下にサンプルファイルがあります.自分のディレクトリにコピーしてからご利用ください.

lmpcc: /Samples

ジョブの投入

・作成したジョブスクリプトを以下のようにジョブスケジューラに投入します.

% qsub -q <キュークラス名> <ジョブスクリプト>


・ジョブの開始/終了時にメール通知をしたい場合は以下のようにジョブを投入します.

% qsub -q <キュー名> -M <mail address> -m be <ジョブスクリプト名>

 -M <メールのあて先>
 -m be  [b -> begin(ジョブ開始) , e -> end(ジョブ終了)]

 

・ジョブ削除を削除したい場合は以下のよう行います.
なお、ジョブの所有者以外は実行できません.

% qdel <Job id>

 

 

キュークラス

シングルノード(Large Memory Cluster)向け:

クラス ノード数 コア数 メモリ実行時間 同時実行ジョブ数 同時実行ジョブ数/1ユーザ
SINGLE ~0.25node ~16core ~384GB1week 90job 16job
SINGLE-4
~1node ~64core ~1.5TB1week 20job 16job
LONG ~0.25node ~16Core ~384GB3week 16job 4job

SuperLarge ノード(12TB, 6TB サーバ) 向け:

クラス コア数 メモリ実行時間 同時実行ジョブ数 同時実行ジョブ数/1ユーザ
XLARGE-6T ~72Core 6TB1week 2job 1job
XLARGE-12T ~144Core 12TB1week 4job 1job

FLOAT (高優先:CPUの異なるノードで動作する場合があります):

クラス コア数 メモリ実行時間 同時実行ジョブ数 同時実行ジョブ数/1ユーザ 優先度
TINY ~64Core ~1TB1hour 32job - 1
FLOAT ~16Core ~384GB1week 90job 16job 2

Materials Studio専用:

クラス ノード数 コア数 メモリ実行時間 同時実行ジョブ数 同時実行ジョブ数/1ユーザ
MatStudio 0.125node ~8core ~192GB1week 40job 40job
MS_Dmol3 0.125node~8core ~192GB1week 90job 32job
MS_Castep 0.125node ~8core ~192GB1week 60job 32job
MS_Forcite 0.125node ~8core ~192GB1week 1job 1job
MS_Compass 0.125node ~8core ~192GB1week 1job 1job
MS_Amorphous 0.125node ~8core ~192GB1week 1job 1job
MS_Dftbplus 0.125node ~8core ~192GB1week 1job 1job
  • MatStudioキューのみMaterials Studio Gatewayユーザ専用キューとなります.
  • その他のキューに投入されたジョブは,各ライセンスが利用可能になるまで実行を待機します.

マルチノード向け:

  • 通常,MPI等を利用しない場合はジョブのマルチノード化はできません
    (ジョブは正常に開始しますが,実際の計算はシングルノード内のみで実行されます)
クラス ノード数 コア数 実行時間 同時実行ジョブ数 同時実行ジョブ数/1ユーザ
SMALL 2~4node ~256core 1week 8job 4job
LARGE 5~8node ~512core 48hour 2job 1job

申請キュー:

クラス ノード数 チャンク数 コア数 実行時間 同時実行ジョブ数 同時実行ジョブ数/1ユーザ
LONG-L ~node - - (申請ベース) - -