Cray XC30 の変更点 - MPC for JAIST

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[[MPC Group]]/[[並列計算機]]
*Cray XC30 [#cc3631e8]
Hostname: xc30.jaist.ac.jp
-System 360nodes / 5760cpu cores
--Node Spec
---Intel Xeon E5-2670 2.6GHz (Sandy-Bridge) 8Cores * 2sockets
---Memory 64GB
-Compilar
--Cray, Intel, GNU
-Library
--LibSC(BLAS, LAPACK, BLACS, SCALAPACK, SuperLU), CrayFFT, FFTW, IRT
-Software
-- OpenMX(under-construction), Quantum-Espresso, Wien2K, SIESTA, VASP
-- #/work/appli/
-- #VASPに関してはライセンスの使用制限があり，センターに連絡
-- #OpenMXについては，構築中
--- /work/appli/を参照
--- VASPに関してはライセンスの制約．使用の際はセンターに連絡
--- OpenMXについては最適なものを構築中

*Queue CLASS [#x9ea6430]
|~CLASS|~NODE/CORE|~TIME|~EXECUTABLE JOB|~EXECUTABLE JOB/USR|
|TINY|1-4node/1-64/core|30min|N/A|N/A|
|SMALL|4-16node/64-256core|48hour|N/A|6jobs/usr|
|MEDIUM|16-32node/256-512core|12hour|6job|3job/usr|
|LARGE|32-128node/512-2048core|12hour|2job|1job/usr|
|XLARGE|128-356node/2048-5696core|12hour|1job|1job/usr|
|LONG-S|1-8node/1-128core|1week|4job|1job/usr|
|LONG-M|8-32node/128-512core|96hour|2job|1job/usr|
|LONG-L|360node|application|application|application|

*Example of Script for PBS [#i4fc540d]
 #!/bin/bash
 #PBS -q QUEUE CLASS
 #PBS -l mppwidth=32
 #PBS -l mppnppn=16 
 #PBS -l mppdepth=1
 cd $PBS_O_WORKDIR
 aprun -n 32 -d 1 -N 16 ./a.out

-mppwidth=number of process of mpi
-mppnppn= number of process per nodes
-mppdepth=number of thread <-- &color(red){when a program is mpi parallel, number of thread equal 1.};
-$PBS_O_WORKDIR <-- &color(red){work direcotry};

*Useful Command [#vb40aa95]
|Command|Description|
|qsub <PBS script>| submit a job to PBS batch system|
|nqstat | confirm the state of job|
|qdel <PBS script>| abort your job|

情報科学センターのページ~
http://isc-w3.jaist.ac.jp/iscenter/index.php?id=300