SGI AltixUV1000

MPC Group/並列計算機

SGI Altix UV1000 †

Hostname: altix.jaist.ac.jp

• System 96nodes / 1536cpu cores
  • Node Spec
    • Intel Xeon Processor E7-8837 * 2sockets
    • Memory 128GB
• Compilar
  • Intel C, C++, Fortran
• Library
  • Intel MKL, VTune, Trace Analyzer, etc...

Queue CLASS †

Example of Script for PBS †

32並列の場合，1ノード8コアより4ノード(select=4)を指定する．

MPI CASE †

#!/bin/bash
#PBS -q QUEUE CLASS
#PBS -l select=4:ncpus=8
cd $PBS_O_WORKDIR
NNODES=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`
NPROCS=`expr $NCPUS \* $NNODES`
mpirun -np $NPROCS dplace -s1 ./a.out

OMP CASE †

#!/bin/bash
#PBS -q QUEUE CLASS
#PBS -l select=4:ncpus=8
cd ${PBS_O_WORKDIR}
export KMP_AFFINITY=disabled
export OMP_NUM_THREADS=32
dplace -x2 ./a.out

Hybrid CASE †

#!/bin/bash
#PBS -q QUEUE CLASS
#PBS -l ncpus=32
cd ${PBS_O_WORKDIR}
export KMP_AFFINITY=disabled
export OMP_NUM_THREADS=4
mpirun -np 32 omplace -nt ${OMP_NUM_THREADS} ./a.out

情報社会基盤研究センターのページ
http://isc-w3.jaist.ac.jp/iscenter/index.php?id=579