並列計算機の使い方

MPC Group

1.はじめに †

本学には，様々なタイプの並列計算機が導入されており，これをうまく使いこなすことで，研究を能率的に行うことができます．ここでは，並列計算機の初歩的な使い方を記述します．

2.ログイン †

まずは，使いたい並列計算機にSSHを用いてログインします．

ssh account@hostname

X-windowを使いたい場合(GUI)

ssh -X account@hostname

3.並列化プログラミング †

• OpenMP
• MPI
• CUDA

などを用いて並列化プログラミング． とりあえず簡単に並列化をしたいという方は，intelコンパイラなどの自動並列化を試してみる．

4.バッチスクリプトの作成 †

各種計算機に応じたスクリプトを作成します．

5.ジョブの実行 †

多くの計算機は，PBSによってジョブが管理されているので，qsubコマンドを用いてジョブを実行します．

6. インタラクティブジョブの実行 †

インタラクティブジョブを実行したい場合は，vSMPやaltix-xeなどの計算機を利用してください．