ログイン・コンパイル
ログイン
接続ホスト名： pcc
% ssh pcc -l <UserID>
環境設定
ログイン時にはデフォルトの開発環境(Intel+IMPI)が設定されています． 利用するコンパイラの変更やライブラリのリンクは必要なモジュールをロードして行います．
1. ロードされているモジュールの一覧表示
% module list
2. 利用可能なモジュールの確認
% module avail
3.モジュールのロード/アンロード
% module load/unload <module name>
4.モジュールの入れ替え
% module swap <module name before> <module name after>
ex1： デフォルトのIntel環境から gnu+OpenMPI に置き換える
% module swap PrgEnv_intel PrgEnv_gnu_openmpi
ex2:CUDA環境(GPU用)のロード
% module load cuda
コンパイル
| コンパイラ | Fortran | C | C++ | 実行コマンド例 |
|---|---|---|---|---|
| GCC | g77,gfortran | cc | g++ | |
| Intel Compiler | ifort | icc | icpc | |
| PGI Compiler | pgf90 | pgcc | pgCC | |
| Intel MPI | mpiifort | mpiicc | mpiicpc | *1 |
| OpenMPI | mpif77, mpif90 | mpicc | mpicxx | *2 |
| MVAPICH2 | mpif77, mpif90 | mpicc | mpicxx | *3 |
*1 : mpirun -machinefile ${PBS_NODEFILE} -np ${NPROCS} ./a.out
*2 : mpirun -hostfile ${PBS_NODEFILE} -np ${NPROCS} ./a.out
*3 : mpirun_rsh -hostfile ${PBS_NODEFILE} -np ${NPROCS} ./a.out